Uczestnicy konkursów w programach operacyjnych mogą liczyć na ułatwienie odwołania od negatywnej decyzji o dofinansowaniu. Nowelizacja wytycznych w tej sprawie podpisana 11 sierpnia 2009 r. przez ministra rozwoju regionalnego Elżbietę Bieńkowską dotyczy przede wszystkim tych podmiotów, których projekty, mimo pozytywnej oceny, nie zmieściły się w budżecie przewidzianym w danym konkursie i umieszczone zostały na liście rezerwowej.
Wyrównuje to szanse z (będącymi paradoksalnie w lepszej sytuacji) wnioskodawcami, których projekty zostały odrzucone, ale którzy mieli prawo odwołać się od negatywnej oceny.
Przy pozytywnym rozpatrzeniu odwołania, weryfikacji podlegać będą jedynie te sporne elementy oceny, które uniemożliwiły dofinansowanie projektu. Ocena projektu zawierać powinna informację na temat „kryteriów oceny, których dany wniosek nie spełnił lub punktacji przyznanej za ich spełnienie”.
Nowelizacja wytycznych wejdzie w życie w dniu ogłoszenia w Monitorze Polskim komunikatu ministra rozwoju regionalnego i obejmie konkursy ogłaszane po 19 grudnia 2008 r.