W wersji 3 znacznie zmieniono graficzny interfejs użytkownika, który teraz nawiązuje do innych aplikacji tego producenta. Udoskonalony Voxler umożliwia ponadto nakładanie na modele terenu poziomic oraz rastrów z odniesieniem przestrzennym – np. zdjęć lotniczych. Aplikację rozbudowano także o obsługę formatów XLSX, ECW, LAS, ZMAP oraz CPS3. Udoskonalono w niej również wyświetlanie danych geologicznych w module FaceRender oraz studni i otworów wiertniczych.
Voxler 3 można nabyć za niecałe 480 dolarów, z kolei aktualizacja do najnowszej wersji kosztuje nieco ponad 150 dolarów.